Untuk memberikan ruang bagi mahasiswa untuk berkembang, Instiper menyediakan unit kegiatan mahasiswa :

-          Resimen Mahasiswa (Menwa) Sat 13

-          Pramuka

-          KSR PMI Unit V Instiper Yogyakarta

-          Pecinta Alam (Mapala) Kapakata

-          Olahraga

-          Kesenian (Komunitas Hijau Daun)

-          Magrove Instiper Club (MIC)

-          Himpunan Mahasiswa Jurusan  (HMJ) di masing-masing jurusan

-          Kerohanian

-     Beladiri